Archiwum Uniwersytetu Jagiellońskiego jest pozawydziałową jednostką organizacyjną Uniwersytetu Jagiellońskiego, podległą Rektorowi UJ, realizującą zadania wskazane w Regulaminie Archiwum Uniwersytetu Jagiellońskiego, w tym zadania archiwum zakładowego i powołaną do koordynowania całokształtu działalności archiwalnej UJ. Nadzoruje postępowanie z dokumentacją w poszczególnych jednostkach organizacyjnych.
Archiwum Uniwersytetu Jagiellońskiego to jedno z najstarszych i największych archiwów uniwersyteckich na świecie. Jego zbiory liczą prawie osiem tysięcy metrów bieżących akt. W skład zasobu Archiwum UJ wchodzą liczne zespoły archiwalne, między innymi akta urzędu rektora, zgromadzenia ogólnego uniwersytetu, senatu, administracji uniwersyteckiej, wydziałów, kolegiów, burs, katedr, seminariów, zakładów, instytutów, kierunków i specjalizacji studiów, stowarzyszeń i organizacji, masowe akta studenckie, dokumentacja majątkowa.
Zbiory Archiwum UJ gromadzą też dokumentację pozaaktową jak spuścizny osób prywatnych, pieczęcie, medale, plakaty oraz audiowizualną: fotografie, filmy, nagrania radiowe.
Jednocześnie Archiwum Uniwersytetu Jagiellońskiego jest jednostką, która łączy w swojej działalności funkcje dokumentacyjne, informacyjne, edukacyjne i naukowo-badawcze. Szczególnym przedmiotem naszych zainteresowań jest historia Uniwersytetu Jagiellońskiego od pierwszej fundacji w 1364 r. do czasów współczesnych. Współpracujemy w procesie dydaktycznym szkolenia studentów UJ i innych uczelni poprzez organizację pokazów archiwalnych. Oferujemy również możliwość odbycia u nas praktyk w zakresie archiwistyki.